Programa de Genética bacteriana y viral

PARTE I: Genética Bacteriana

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Unidad 1: Fundamentos de la genética bacteriana y viral.
Estructura y Función del ácido nucleico bacteriano. ADN. ARN. Conformación de la doble hélice–ADN lineal y súper-enrollado. Replicación del ADN: fidelidad y mecanismos de reparación. Modelo general de recombinación: proteínas RecA. Mecanismos de reparación del ADN. Mecanismos de transformación genética: transducción, conjugación, fusión de protoplastos, electroporación. Enzimas modificadoras del ADN. Enzimas de restricción. Técnicas para el análisis de moléculas de ADN: electroforesis, PCR, secuenciación, footprinting, EMSA, simple-doble-triple híbrido.

Unidad 2: Mutaciones y Variabilidad
Tipos de mutaciones. Fenotipos: Reversión y complementación. Variación. Mediación tasa de mutación. Recombinación. Supresores. Mecanismos de mutación: espontánea, por agentes químicos, radiación ultravioleta. Mutaciones sitio-dirigidas. Aislamiento e identificación de mutantes: métodos moleculares. Replica platting.

Unidad 3: Regulación de la expresión génica en bacterias
Mecanismos de transcripción y traducción. Control transcripcional: promotores, terminadores, atenuadores. Unidades simples de regulación: Los operones: lactosa, galactosa, triptofano. Regulones. Control traduccional. Modificaciones postraduccionales. Organización de los genes dentro del genoma.

Unidad 4: Plásmidos- Transferencia de genes
Características moleculares de los plásmidos. Control de la Replicación. Estabilidad. Clasificación de los plásmidos. Metodologías de estudio. Transferencia de genes: Transformación estable: células competentes. Captación y entrada del ADN. Electroporación. Transfección. Conjugación: mecanismos. Plásmido F. Interacción con el cromosoma bacteriano. Integración-Excisión. Transducción. Tipos de Recombinación.

Unidad 5: Bacteriófagos
Bacteriófagos con ADN simple hebra. Fagos ARN. Fagos ADN doble hebra: Bacteriófago T4. Bacteriófago lambda: Ciclo lítico y lisogénico. Restricción y modificación. Importancia de los fagos. Phage display.

Unidad 6: Aplicaciones usando bacterias
Desarrollo de cepas: generación y selección de variantes. Clonado Molecular: enzimas modificadores de ácidos nucleicos. Enzimas de restricción. Vectores: plásmidos y bacteriófagos  y M13. Transformación. Bibliotecas. Construcción de bibliotecas genómicas y de ADNc. Screening. Vectores de expresión. Producción de proteínas recombinantes. Nuevas vacunas. Mapeo de genes. Técnicas moleculares para el mapeo de genes. Secuenciación: determinación de secuencias. Análisis y comparación de secuencias. Bioinformática. Mutaciones sitio-dirigidas

Unidad 7: Elementos móviles. Transposones
Principios generales. Doble recombinación sitio-específica. Integración de fago lamba. Inserción de secuencias. Estructura de las secuencias insertadas. Ocurrencia. Transposones: estructura. Mecanismos de transposición: simple recombinación sitio-específica. Integrones. Tipos y regulación de los mecanismos de transposición. Activación de genes por transposones. Variaciones de fase.

PARTE II: Genética Viral

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Unidad 8: Características generales de los Virus
Estructura de los virus. Los virus como parásitos intracelulares. Principales criterios que definen a los virus: tamaño y contenido genético, simetría y composición de la cápside. Virus envueltos o desnudos. Mecanismos y metodologías para el cultivo, la detección y estrategias moleculares de análisis de los virus.

Unidad 9: Biología de los Virus
Genomas Virales: Estructura y complejidad de los genomas virales. Virus ADN y ARN.
Estructura: cubiertas protectoras, empaquetamiento del ácido nucleico viral. Composición de la envoltura viral. Adhesión y entrada al huésped: mecanismos de entrada. Transporte del genoma viral al núcleo de la célula huésped. Importación de genomas de tipo ADN, mecanismos de importación de retrovirus. Transformación celular por el virus.

Unidad 10: Genomas virales I
Virus con Genomas ARN, estrategias de replicación. Mecanismos de síntesis de ARN viral: ARN polimerasas dependientes de ARN. Características del material genético. Elongación. Reconocimiento y Síntesis del ARN viral por el huésped. Origen de la diversidad en los virus ARN: misincorporación de nucleótidos, generación de mutantes. Retrovirus: Vías de trascripción reversa e integración del ADN. ARN polimerasas dependientes de ADN, estructura y principales características. Genética retroviral.

Unidad 11: Genomas virales II
Estrategias de replicación de virus ADN. Mecanismos de síntesis de ADN viral. Síntesis por la maquinaria celular. Síntesis de ADN viral por el propio virus. Origen de la diversidad de los virus ADN: Mecanismos de Recombinación. Fidelidad de las ADN polimerasas. Procesamiento del Pre-mARN viral. Maduración, Splicing, Editado. Regulación de la estabilidad del ARN mensajero viral. Estrategias de traducción de los virus. Regulación de la traducción durante una infección viral.

Unidad 12: Tráfico intracelular
Ensamblado en el núcleo o en la membrana. Interacción con la maquinaria celular del huésped. Maduración. Genética de infecciones más importantes: HIV, virus oncogénicos. Vacunas: vectores virales y sus aplicaciones, vacunas de ADN, nuevas tecnologías.

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